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恒溫磁力攪拌器的溫度控制方式通常有以下兩種：
1、加溫板有一個熱慣性，溫度控制可能高于設置溫度，如果要求較高，應注意控制溫度的加溫板(即加溫電壓)。使用電接觸汞控制溫度，當溫度高于電點水銀溫度計設置溫度，傳感器溫度控制方法是設置溫度在主機上。因此，控制溫度傳感器比較方便。但傳感器采用金屬材料，所以沒有腐蝕程度的電接觸玻璃水銀溫度計。
2、通過控制溫度傳感器(電動)，接觸汞和電力在使用過程中傳感器的一端進入測量液體，另一端連接到儀器上，在這個過程中溫度的控制，當液體溫度低于設置溫度，加溫板加溫，當溫度到設置溫度的液體，然后由電點水銀溫度計或傳感器信號到主機磁力攪拌器、加溫板停止加溫，再當溫度低于設置溫度，加溫板的繼續加溫，這是磁性的原理，混合器溫度控制。
恒溫磁力攪拌器能適應大多數控制系統，只有控制效果不好時方可啟動自整定，按SET鍵3秒進入儀表內層菜單，選定參數AT后配合▽或△鍵開啟自動整定。此時AT指示等開始閃爍儀表進入自動整定參數工作狀態，儀表控制加熱系統在設定點附近波動2次，當AT燈滅時自動整定結束，新的參數被鎖存在芯片中。
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